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遗传过敏性皮炎比较容易和湿疹、慢性单纯性苔藓，还有婴儿脂溢性皮炎这几种疾病相混淆。
首先，湿疹，一般无家族史，也无一定的好发部位。
第二，慢性单纯性苔藓，表现为苔藓样变和多角形扁平丘疹，无个人和家族遗传过敏史，无特殊的皮疹发生和发展规律，无血清和皮肤点刺实验的异常发现。
第三，婴儿脂溢性皮炎，常发生于婴儿的头皮、耳后、眉间、鼻唇沟等处，以灰黄色或棕黄色油腻性鳞屑为特征性皮损，无遗传过敏家族史。