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主要是改变IP3的结构，通过两种方式: ①IP3被水解,即IP3在5'-磷酸酶的作用下,水解为I(1,4)P2,并且进一步水解成肌醇。5'磷酸酶是一种膜结合的酶。 ②在胞浆的肌醇磷酸脂3-激酶的作用下,IP3被ATP磷酸化生成肌醇-1,3,4,5-四磷酸(inositol-1,3,4,5-tetraphosphate,IP4),然后被水解成无活性的肌醇-1,3,4-三磷酸(inositol-1,3,4-trisphosphate)从而解除IP3的作用。