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缩短灭菌时间可以降低燃料成本，提高常压灭菌锅的工作效率。有效方法是：在培养料使用前进行发酵。其机理是发酵期的升温使细菌芽孢萌发生长为营养体，细菌营养体菌体的耐热性低于芽孢。所以发酵后的培养料，灭菌时间可以缩短2~4小时，但是这种方法对有些食用菌种类不适用，如木腐菌的香菇、黑木耳等，但可以短时间发酵，如发酵1~2天。