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1940年属桂林市凤北镇、西南附廓乡，1950年设第三区和北郊区，1955年改三皇、北站2街道，1958年改三皇、北站2公社，1966年更名东风、胜利公社，1979年东风、胜利公社合并置叠彩区。
1996年12月2日，国务院批准对桂林市市辖区的行政区划作相应调整：扩大叠彩区的行政区域，将原郊区大河乡、穿山乡的清风村划归叠彩区管辖。区政府驻凤北路。
2000年，叠彩区辖2个街道、1个乡。2006年1月6日，叠彩区人民政府从凤北路8号搬迁至中山北路147号。