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新合成的45SrRNA很快与蛋白质形成RNP复合体（80S的RNP），45SrRNA甲基化以后经RNA酶裂解为2个分子，18SrRNA和32SrRNA，后者再裂解为28SrRNA的5.8SrRNA。成熟的rRNA仅为45SrRNA的一半，丢失的大部分是非甲基化和GC含量较高的区域。5SrRNA合成后被转运至核仁区参与大亚基的装配。