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1、烤鱼一般会用草鱼、黑鱼、鲈鱼、清江鱼、巴沙鱼等。用于烧烤的鱼最好是选择新鲜的、肉质肥厚的且鱼刺较少的种类，这样制作出来的菜肴才会更香，更美味。市场上比较常见的烤鱼有草鱼、鲤鱼、鲶鱼、清江鱼、鮰鱼、海鲈鱼、花鲢鱼、鲫鱼、湄公鱼、黑鱼、鳜鱼、罗非鱼等。
2、有些鱼由于其肉质过于硬，譬如金鲳鱼、三文鱼，就不适合做烤鱼。从杂食和食草区分，更偏向选择食草类的鱼，因为杂食类的鱼，虽然体积大，长得也快，但生存水质要求很低，耐低氧，污染严重的水塘里也很容易大量繁殖，比如鲶鱼虽然刺少，但肉质一般。